成都中医药大学赵凌，迎来2024年第4篇SCI！
论论资讯 ｜ 2024-04-29 ｜
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Translational Stroke Research
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Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Unveils Efferocytosis Patterns and ceRNA Network in Ischemic Stroke
Yuan Jing; Liao Yu-Sha; Zhang Tie-Chun; Tang Yu-Qi; Yu Pei; Liu Ya-Ning; Cai Ding-Jun; Yu Shu-Guang; Zhao Ling
Published：2024-04-28
DOI：10.1007/s12975-024-01255-8
研究背景
随着社会的发展，中风（IS）等疾病对人们的健康造成了重大影响。然而，目前对于中风后炎症反应过度的探讨仍不够深入，这对患者的功能恢复产生了负面影响。在IS患者的脑组织中，细胞凋亡的清除是减轻炎症反应的重要机制，为IS的治疗提供了一个有前景的途径。然而，关于IS后脑部细胞和分子机制以及其对脑损伤和康复的影响仍知之甚少。
研究内容
最近一篇发表在《Translational stroke research》期刊上的论文揭示了一项关于IS中细胞吞噬和竞争性内源性RNA网络的研究。研究使用了生物信息学方法，探讨了炎症和细胞吞噬在IS中的作用。通过分析不同表达基因（DEGs），进行了GSEA、GO和KEGG通路分析。同时，还通过文献调研鉴定了与细胞吞噬相关的基因，研究了DEGs与这些基因之间的关系。随后，利用单细胞数据集进行了细胞吞噬相关基因的表达分析。研究还验证了在人脑和外周血样本数据集中识别的枢纽基因。通过预测竞争性内源性RNA网络和验证miRNA的表达，确定了miR-125b-5p作为IS的治疗靶点。最后，通过MCAO模型验证了细胞吞噬过程和枢纽基因Abca1的表达。
研究意义
这项研究的创新之处在于揭示了IS中细胞吞噬模式和ceRNA网络的重要性，为IS治疗提供了新的思路。通过识别关键的细胞吞噬相关基因和转录因子，研究指出了microglia和macrophages在脑中具有细胞吞噬功能。此外，确定了miR-125b-5p作为IS的潜在治疗靶点，为未来的治疗研究提供了有力支持。最终，通过动物模型实验证实了细胞吞噬过程和枢纽基因Abca1的表达，为将来的临床应用奠定了基础。
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