复旦大学附属中山医院Jiang, Kanglun与黄新生等：mRNA表达谱的鉴定及其在年龄相关性听力损失中的表征
论论资讯 ｜ 2024-04-29 ｜
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Cellular and Molecular Biology
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Identification of mRNA expression profiles and their characterization in age-related hearing loss
Jiang Kanglun; Wang Tan; Huang Xinsheng; Gao Li
Published：2024-04-28
DOI：10.14715/cmb/2024.70.4.40
研究背景
随着人口老龄化问题日益突出，年龄相关性听力丧失（ARHL）成为全球性健康难题。这种听力问题不仅严重影响生活质量，还据报道导致老年人社交孤立和痴呆症。ARHL通常由耳蜗毛细胞和听神经的退化或紊乱引起。虽然许多研究证实遗传因素导致了这种损伤，但背后的机制仍不清楚。
研究内容
这项研究分析了来自GEO数据库的mRNA表达数据集（GSE49543）。使用limma和加权基因共表达网络分析（WGCNA）方法，对年轻对照小鼠和老年性听力丧失小鼠之间的差异表达基因（DEGs）进行了分析。通过clusterProfiler和ggplot2 R软件包进行DEGs的功能富集分析，使用STRING数据库构建筛选DEGs的蛋白质相互作用（PPI）网络。利用LASSO和SVM-RFE两种机器学习算法筛选核心基因。我们在老年性听力丧失中鉴定了54个DEGs，这些DEGs与突触囊泡循环、远端轴突、神经递质跨膜转运蛋白活性相关。根据KEGG分析，这些DEGs与酒精性肝病、百日咳、溶酶体通路相关。PPI网络分析确定了三个显著模块。LASSO和SVM-RFE筛选出5个核心基因（CLEC4D、MS4A7、CTSS、LAPTM5、ALOX5AP），这些核心基因在老年性听力丧失小鼠中高表达。
研究意义
通过筛选DEGs并鉴定参与ARHL发展的核心基因，我们或许可以为理解ARHL的分子基础提供新线索。这项研究的创新性在于通过基因表达特征揭示了ARHL的潜在机制，为未来的治疗和预防提供了重要参考。
这篇论文为我们带来了对年龄相关性听力丧失的深入了解，为相关领域的研究提供了新的启示。希望通过这些努力，能够为改善老年人听力健康状况提供更多的帮助和支持。
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