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论论资讯 | 2023-10-15 |
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Molecular Cancer
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Pan-cancer spatially resolved single-cell analysis reveals the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and tumor microenvironment
Ma Chenxi; Yang Chengzhe; Peng Ai; Sun Tianyong; Ji Xiaoli; Mi Jun; Wei Li; Shen Song; Feng Qiang
Published:2023-10-13
DOI:10.1186/s12943-023-01876-x
研究背景
癌症是当今社会的重要问题之一,而肿瘤微环境也是近年来备受关注的研究领域。然而,当前的研究仍存在着许多问题,如癌症细胞与肿瘤微环境之间的相互作用机制尚未完全阐明。因此,本研究旨在通过单细胞空间分辨率分析,深入探究癌相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用机制。
研究内容
通过对六种常见癌症类型的空间和单细胞转录组数据的综合分析,本研究确定了四个不同的癌相关成纤维细胞亚群,并描述了它们的空间分布特征。此外,通过对三种其他常见癌症类型和两种新生成的罕见癌症类型(上皮肌上皮瘤和黏液表皮样癌)的单细胞RNA测序数据的分析,扩展了我们对癌相关成纤维细胞异质性的理解。在空间上进行的细胞间相互作用分析突出了基质型癌相关成纤维细胞在肿瘤血管生成中的关键作用和炎症型癌相关成纤维细胞在塑造免疫抑制微环境中的作用。在进行抗PD-1免疫治疗的乳腺癌(BRCA)患者中,炎症型癌相关成纤维细胞表现出促进癌细胞增殖、促进上皮间充质转化和有助于建立免疫抑制微环境的能力。此外,基于炎症型癌相关成纤维细胞的评分系统与黑色素瘤患者的免疫治疗反应显著相关。最后,我们提供了一个网站界面(https://chenxisd.shinyapps.io/pancaf/),供研究社区在全癌症范围内研究癌相关成纤维细胞。
研究意义
本研究通过单细胞空间分辨率分析,揭示了癌相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用机制,发现了不同的癌相关成纤维细胞亚群,并描述了它们的空间分布特征。此外,本研究还发现了炎症型癌相关成纤维细胞在肿瘤发展中的重要作用,并提出了一个评分系统,可用于预测黑色素瘤患者对免疫治疗的反应。这些发现不仅有助于深入了解癌症的病理生理学机制,还为癌症的治疗提供了新的思路和方法。

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