Xu, Qiu2024年最新论文：脓毒症中丙酮体相关生物标志物和免疫浸润的表征
论论资讯 ｜ 2024-04-29 ｜
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Journal of Inflammation Research
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Cuproptosis-Related Biomarkers and Characterization of Immune Infiltration in Sepsis
Wang Yuanfeng; Qiu Xu; Liu Jiao; Liu Xuanyi; Pan Jialu; Cai Jiayi; Liu Xiaodong; Qu Shugen
Published：2024-01-01
DOI：10.2147/jir.s452980
研究背景
社会上，脓毒症作为全球性流行病，导致高发病率和死亡率，一直备受关注。然而，目前研究领域存在的问题之一是我们对脓毒症中细胞死亡形式——血铜死亡的认识还不够清晰。这种细胞死亡方式与多种疾病有关，但具体机制尚不明确。
研究内容
最新研究发表在《炎症研究杂志》上，题为《脓毒症中的血铜死亡相关生物标志物及免疫浸润特征》。研究使用了LASSO算法和SVM-RFE模型分析了脓毒症中与血铜死亡相关基因的表达情况，以及免疫细胞浸润的特征，并鉴定了诊断模型下的标记基因。通过基因-药物网络、mRNA-miRNA网络和PPI网络的构建，筛选出潜在的生物学靶点。在GSE57065数据集的基础上验证了标记基因的表达情况。研究运用共识聚类方法对脓毒症样本进行分类。
研究意义
研究发现了与脓毒症发展相关的381个基因，以及在脓毒症中16种细胞类型中显著差异表达的血铜死亡相关基因，其中CD8/CD4 T细胞较低。通过LASSO算法和SVM-RFE模型，确定了<i>NFE2L2、NLRP3、SLC31A1、DLD、DLAT、PDHB、MTF1、CDKN2A</i>和<i>DLST</i>等基因作为标记基因。其中<i>PDHB</i>和<i>MTF1</i>的AUC值均大于0.9。验证组数据表明，<i>PDHB</i>（<i>P</i>=0.00099）和<i>MTF1</i>（<i>P</i>=7.2e-14）的统计学显著性。一致的聚类分析确认了两个亚型。C1亚型可能与细胞代谢更相关，而C2亚型则与免疫分子有关。动物实验结果显示，基因表达与生物信息分析一致。
这项研究系统地探讨了脓毒症与血铜死亡之间的关系，并构建了一个诊断模型。此外，几个血铜死亡相关基因可能通过免疫细胞浸润干扰脓毒症的进展。这一发现为我们更好地理解脓毒症提供了新的线索。
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