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Semmelweis Egyetem:可变片段长度等位基因特异性聚合酶链式反应(VFLASP),一种简单可靠的基因分型方法

论论资讯 | 2023-04-20

Molecular and Cellular Probes

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Variable fragment length allele-specific polymerase chain reaction (VFLASP), a method for simple and reliable genotyping

Tóth T.; Csaba Á.; Bokor A.; Ács N.

Published:2023-06-01
DOI:10.1016/j.mcp.2023.101910

研究背景

单核苷酸多态性(SNP)是指基因组中特定位置的单个核苷酸替换。目前已经在人类基因组中发现了5.85亿个SNP,因此需要一种广泛适用的方法来检测特定的SNP。然而,现有的基因分型方法存在一些问题,例如可能会出现假阳性结果等。

研究内容

为了解决这些问题,研究人员开发了一种新的基因分型方法,名为可变片段长度等位基因特异性聚合酶链反应(VFLASP)。该方法利用荧光PCR技术,同时引入两个等位基因特异性引物,其中一个引物的长度通过在5'端添加适配器序列来改变。这种方法可以排除不存在等位基因的假扩增,确保扩增正确的等位基因。与其他复杂的基因分型方法不同,VFLASP方法基于不同等位基因扩增产物的长度差异来区分它们。在实验中,研究人员测试了包含六种不同碱基变异的六个SNP,通过毛细管电泳检测扩增产物后,得到了清晰可靠的结果。

研究意义

该研究的创新点在于开发了一种简单可靠的基因分型方法,可以广泛适用于中小型实验室。这种方法可以排除假阳性结果,同时不需要使用复杂的荧光染料技术,仅通过扩增产物长度差异即可区分不同等位基因。这种方法的应用将有助于加快基因分型的速度和准确性,为基因组学研究提供更加可靠的数据支持。

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