扫码下载APP

您的位置

资讯详情

本人可编辑资讯

仅支持在APP编辑资讯扫描二维码即可下载APP

郑州大学:异源四倍体油菜中十字花科组蛋白修饰基因的全基因组鉴定及其对非生物胁迫的响应

论论资讯 | 2023-05-14 4热度

BMC Plant Biology

Explore content

About the journal

Publish with us

Genome-wide identification of Brassicaceae histone modification genes and their responses to abiotic stresses in allotetraploid rapeseed

Hu Lin-Lin; Zheng Li-Wei; Zhu Xin-Lei; Ma Sheng-Jie; Zhang Kai-Yan; Hua Ying-Peng; Huang Jin-Yong

Published:2023-05-11
DOI:10.1186/s12870-023-04256-1

研究背景

植物对于环境的适应性一直是研究者们关注的焦点之一。其中,组蛋白修饰是一种重要的表观遗传调控机制,对于植物的逆境适应至关重要。然而,目前缺乏对于十字花科植物中组蛋白修饰基因(HMs)的系统性分析,也未能明确这些基因在逆境应答中的作用。

研究内容

最近,一项发表在BMC植物生物学杂志上的研究对此进行了深入探究。研究人员在九种十字花科植物中鉴定出102个AtHMs、280个BnaHMs、251个BcHMs、251个BjHMs、144个BnHMs、155个BoHMs、137个BrHMs、122个CrHMs以及356个CsHMs,分别进行了染色体定位、蛋白质/基因结构、系统发育树和合成分析。此外,研究人员还发现了一些Brassicaceae HMs的特定结构域,这表明这些基因与多种功能相关。合成分析显示,Brassicaceae HMs的扩张可能是由于染色体片段和全基因组重复。通过共表达网络分析,确定了在异源四倍体油菜中,9个关键的BnaHMs可能负责氨、盐、硼、镉、硝酸盐和钾应激。此外,根据加权基因共表达网络分析(WGCNA),12个BnaHMs与应激适应有关。在上述基因中,BnaPRMT11基于差异表达分析同时对四种不同应激做出了响应,而BnaSDG46、BnaHDT10和BnaHDA1参与了五种应激。BnaSDG46还基于WGCNA参与了四种不同应激,而BnaSDG10和BnaJMJ58在六种不同应激中分别差异表达。总之,研究人员确定了六个应激抗性候选基因(BnaPRMT11、BnaSDG46、BnaSDG10、BnaJMJ58、BnaHDT10和BnaHDA1)。

研究意义

这项研究结果有助于澄清Brassicaceae HMs的生物学作用,并为潜在的耐逆油料植物的开发提供了重要的参考。此外,研究人员还发现了一些关键的HMs基因,这些基因在逆境应答中起着重要的作用,对于人们更好地理解植物逆境适应机制具有重要意义。

微信扫码即可查看